На главную страницу третьего семестра

Эволюционная модель

Скобочная формула и построенное на её основе дерево

Описание модельного филогенетического дерева

Скрипт для получения мутантных последовательностей с помощью программы msbar

Длина гена метионил-тРНК синтетазы E.coli - 2034 нуклеотида
msbar sym_gene.fasta  f.fasta -point 4 -count 2034 -auto
msbar sym_gene.fasta  4.fasta -point 4 -count 610 -auto
msbar 4.fasta e.fasta -point 4 -count 1424 -auto
msbar 4.fasta 3.fasta -point 4 -count 407 -auto
msbar 3.fasta 2.fasta -point 4 -count 203 -auto
msbar 3.fasta d.fasta -point 4 -count 1017 -auto
msbar 2.fasta a.fasta -point 4 -count 814 -auto
msbar 2.fasta 1.fasta -point 4 -count 488 -auto
msbar 1.fasta b.fasta -point 4 -count 325 -auto
msbar 1.fasta c.fasta -point 4 -count 325 -auto
              
-point 4 - показывает, что необходимый тип мутаций - замены.

-auto - говорит программе не запрашивать больше никаких параметров, кроме указанных


© Фадеев Андрей, 2005